O SIE, através de seu módulo de Recursos Humanos, possibilita integração com o SIAPE. Esta integração, ou interoperabilidade, se dá através da extração de dados do SIAPE para o SIE por meio da fita espelho e outros arquivos. O contrário também ocorre, o SIE é capaz de exportar dados de um funcionário para o SIAPE, como pode ser visto nas figuras abaixo:
Porém, essa interoperabilidade da forma que está em funcionamento hoje, demanda a execução de diversos procedimentos até ser concluída. Pensando em simplificar esta tarefa esta sendo desenvolvida, através do ASTEN Processos, um processo de automatização das tarefas, reduzindo a quantidade de passos realizados na troca de informações, ficando como na figura abaixo:
